Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0U9

Arv1, Protein ARV1, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arv1Q9D0U9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arv1Q9D0U9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arv1Q9D0U9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arv1Q9D0U9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arv1Q9D0U9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arv1Q9D0U9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arv1Q9D0U9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arv1Q9D0U9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arv1Q9D0U9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arv1Q9D0U9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arv1Q9D0U9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arv1Q9D0U9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arv1Q9D0U9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arv1Q9D0U9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arv1Q9D0U9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arv1Q9D0U9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arv1Q9D0U9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arv1Q9D0U9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arv1Q9D0U9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Arv1Q9D0U9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arv1Q9D0U9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arv1Q9D0U9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arv1Q9D0U9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arv1Q9D0U9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arv1Q9D0U9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arv1Q9D0U9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arv1Q9D0U9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arv1Q9D0U9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arv1Q9D0U9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arv1Q9D0U9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arv1Q9D0U9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Arv1Q9D0U9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arv1Q9D0U9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arv1Q9D0U9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arv1Q9D0U9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arv1Q9D0U9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arv1Q9D0U9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arv1Q9D0U9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arv1Q9D0U9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arv1Q9D0U9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arv1Q9D0U9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arv1Q9D0U9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arv1Q9D0U9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arv1Q9D0U9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arv1Q9D0U9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arv1Q9D0U9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arv1Q9D0U9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arv1Q9D0U9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arv1Q9D0U9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arv1Q9D0U9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms