Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0K0

Tbc1d7, TBC1 domain family member 7, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d7Q9D0K0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tbc1d7Q9D0K0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tbc1d7Q9D0K0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tbc1d7Q9D0K0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tbc1d7Q9D0K0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tbc1d7Q9D0K0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tbc1d7Q9D0K0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tbc1d7Q9D0K0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tbc1d7Q9D0K0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tbc1d7Q9D0K0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tbc1d7Q9D0K0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tbc1d7Q9D0K0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tbc1d7Q9D0K0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tbc1d7Q9D0K0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tbc1d7Q9D0K0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tbc1d7Q9D0K0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tbc1d7Q9D0K0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tbc1d7Q9D0K0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tbc1d7Q9D0K0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tbc1d7Q9D0K0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tbc1d7Q9D0K0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tbc1d7Q9D0K0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tbc1d7Q9D0K0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tbc1d7Q9D0K0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tbc1d7Q9D0K0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tbc1d7Q9D0K0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tbc1d7Q9D0K0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tbc1d7Q9D0K0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tbc1d7Q9D0K0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tbc1d7Q9D0K0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tbc1d7Q9D0K0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tbc1d7Q9D0K0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tbc1d7Q9D0K0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tbc1d7Q9D0K0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tbc1d7Q9D0K0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tbc1d7Q9D0K0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tbc1d7Q9D0K0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tbc1d7Q9D0K0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tbc1d7Q9D0K0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tbc1d7Q9D0K0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tbc1d7Q9D0K0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tbc1d7Q9D0K0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tbc1d7Q9D0K0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tbc1d7Q9D0K0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tbc1d7Q9D0K0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Tbc1d7Q9D0K0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tbc1d7Q9D0K0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tbc1d7Q9D0K0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tbc1d7Q9D0K0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tbc1d7Q9D0K0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tbc1d7Q9D0K0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tbc1d7Q9D0K0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tbc1d7Q9D0K0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tbc1d7Q9D0K0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tbc1d7Q9D0K0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tbc1d7Q9D0K0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tbc1d7Q9D0K0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tbc1d7Q9D0K0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tbc1d7Q9D0K0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tbc1d7Q9D0K0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tbc1d7Q9D0K0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tbc1d7Q9D0K0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tbc1d7Q9D0K0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tbc1d7Q9D0K0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tbc1d7Q9D0K0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tbc1d7Q9D0K0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tbc1d7Q9D0K0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tbc1d7Q9D0K0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tbc1d7Q9D0K0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tbc1d7Q9D0K0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tbc1d7Q9D0K0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tbc1d7Q9D0K0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tbc1d7Q9D0K0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tbc1d7Q9D0K0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tbc1d7Q9D0K0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tbc1d7Q9D0K0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tbc1d7Q9D0K0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tbc1d7Q9D0K0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tbc1d7Q9D0K0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tbc1d7Q9D0K0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tbc1d7Q9D0K0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tbc1d7Q9D0K0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tbc1d7Q9D0K0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tbc1d7Q9D0K0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tbc1d7Q9D0K0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tbc1d7Q9D0K0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tbc1d7Q9D0K0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tbc1d7Q9D0K0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tbc1d7Q9D0K0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tbc1d7Q9D0K0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tbc1d7Q9D0K0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tbc1d7Q9D0K0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tbc1d7Q9D0K0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tbc1d7Q9D0K0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tbc1d7Q9D0K0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tbc1d7Q9D0K0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tbc1d7Q9D0K0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tbc1d7Q9D0K0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tbc1d7Q9D0K0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tbc1d7Q9D0K0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms