Protein–RNA interactions for Protein: Q9D032

Ssbp3, Single-stranded DNA-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp3Q9D032 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssbp3Q9D032 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms