Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW2

Cenpn, Centromere protein N, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpnQ9CZW2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CenpnQ9CZW2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CenpnQ9CZW2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CenpnQ9CZW2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CenpnQ9CZW2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CenpnQ9CZW2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CenpnQ9CZW2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CenpnQ9CZW2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CenpnQ9CZW2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CenpnQ9CZW2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CenpnQ9CZW2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CenpnQ9CZW2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CenpnQ9CZW2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CenpnQ9CZW2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CenpnQ9CZW2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CenpnQ9CZW2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CenpnQ9CZW2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CenpnQ9CZW2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CenpnQ9CZW2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CenpnQ9CZW2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CenpnQ9CZW2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CenpnQ9CZW2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CenpnQ9CZW2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CenpnQ9CZW2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CenpnQ9CZW2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CenpnQ9CZW2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CenpnQ9CZW2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CenpnQ9CZW2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CenpnQ9CZW2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CenpnQ9CZW2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CenpnQ9CZW2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CenpnQ9CZW2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CenpnQ9CZW2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CenpnQ9CZW2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CenpnQ9CZW2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CenpnQ9CZW2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CenpnQ9CZW2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CenpnQ9CZW2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CenpnQ9CZW2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CenpnQ9CZW2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CenpnQ9CZW2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CenpnQ9CZW2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CenpnQ9CZW2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CenpnQ9CZW2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CenpnQ9CZW2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CenpnQ9CZW2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CenpnQ9CZW2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CenpnQ9CZW2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CenpnQ9CZW2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CenpnQ9CZW2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CenpnQ9CZW2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CenpnQ9CZW2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CenpnQ9CZW2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms