Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx7Q9CY18 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Snx7Q9CY18 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx7Q9CY18 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx7Q9CY18 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx7Q9CY18 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx7Q9CY18 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx7Q9CY18 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx7Q9CY18 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx7Q9CY18 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx7Q9CY18 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx7Q9CY18 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx7Q9CY18 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx7Q9CY18 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx7Q9CY18 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx7Q9CY18 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx7Q9CY18 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx7Q9CY18 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx7Q9CY18 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx7Q9CY18 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx7Q9CY18 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx7Q9CY18 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx7Q9CY18 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx7Q9CY18 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx7Q9CY18 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx7Q9CY18 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx7Q9CY18 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx7Q9CY18 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx7Q9CY18 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx7Q9CY18 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx7Q9CY18 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms