Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXY1

Tmem175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem175Q9CXY1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms