Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Exo5Q9CXP9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Exo5Q9CXP9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Exo5Q9CXP9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Exo5Q9CXP9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Exo5Q9CXP9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Exo5Q9CXP9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Exo5Q9CXP9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Exo5Q9CXP9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Exo5Q9CXP9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Exo5Q9CXP9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Exo5Q9CXP9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Exo5Q9CXP9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Exo5Q9CXP9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Exo5Q9CXP9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Exo5Q9CXP9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Exo5Q9CXP9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Exo5Q9CXP9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Exo5Q9CXP9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Exo5Q9CXP9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Exo5Q9CXP9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Exo5Q9CXP9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Exo5Q9CXP9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Exo5Q9CXP9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Exo5Q9CXP9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Exo5Q9CXP9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Exo5Q9CXP9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Exo5Q9CXP9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Exo5Q9CXP9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Exo5Q9CXP9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Exo5Q9CXP9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Exo5Q9CXP9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Exo5Q9CXP9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Exo5Q9CXP9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Exo5Q9CXP9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Exo5Q9CXP9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Exo5Q9CXP9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Exo5Q9CXP9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Exo5Q9CXP9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Exo5Q9CXP9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Exo5Q9CXP9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Exo5Q9CXP9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Exo5Q9CXP9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Exo5Q9CXP9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Exo5Q9CXP9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Exo5Q9CXP9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Exo5Q9CXP9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Exo5Q9CXP9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Exo5Q9CXP9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Exo5Q9CXP9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Exo5Q9CXP9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Exo5Q9CXP9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Exo5Q9CXP9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Exo5Q9CXP9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Exo5Q9CXP9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Exo5Q9CXP9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Exo5Q9CXP9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Exo5Q9CXP9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.7 ms