Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CWU4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CWU4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CWU4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CWU4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CWU4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CWU4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CWU4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CWU4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CWU4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CWU4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CWU4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CWU4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CWU4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CWU4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CWU4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CWU4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9CWU4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9CWU4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9CWU4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9CWU4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9CWU4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9CWU4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9CWU4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CWU4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9CWU4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CWU4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CWU4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms