Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Atxn3Q9CVD2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Atxn3Q9CVD2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atxn3Q9CVD2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atxn3Q9CVD2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atxn3Q9CVD2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atxn3Q9CVD2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atxn3Q9CVD2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atxn3Q9CVD2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atxn3Q9CVD2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atxn3Q9CVD2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atxn3Q9CVD2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atxn3Q9CVD2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atxn3Q9CVD2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atxn3Q9CVD2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atxn3Q9CVD2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atxn3Q9CVD2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atxn3Q9CVD2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atxn3Q9CVD2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atxn3Q9CVD2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atxn3Q9CVD2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atxn3Q9CVD2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atxn3Q9CVD2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atxn3Q9CVD2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atxn3Q9CVD2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atxn3Q9CVD2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atxn3Q9CVD2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atxn3Q9CVD2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atxn3Q9CVD2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atxn3Q9CVD2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atxn3Q9CVD2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atxn3Q9CVD2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atxn3Q9CVD2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atxn3Q9CVD2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atxn3Q9CVD2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atxn3Q9CVD2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atxn3Q9CVD2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atxn3Q9CVD2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atxn3Q9CVD2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atxn3Q9CVD2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atxn3Q9CVD2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atxn3Q9CVD2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atxn3Q9CVD2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atxn3Q9CVD2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atxn3Q9CVD2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atxn3Q9CVD2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atxn3Q9CVD2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atxn3Q9CVD2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atxn3Q9CVD2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atxn3Q9CVD2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atxn3Q9CVD2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atxn3Q9CVD2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atxn3Q9CVD2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atxn3Q9CVD2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atxn3Q9CVD2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atxn3Q9CVD2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atxn3Q9CVD2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atxn3Q9CVD2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atxn3Q9CVD2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atxn3Q9CVD2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atxn3Q9CVD2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atxn3Q9CVD2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Atxn3Q9CVD2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atxn3Q9CVD2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atxn3Q9CVD2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atxn3Q9CVD2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atxn3Q9CVD2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atxn3Q9CVD2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atxn3Q9CVD2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atxn3Q9CVD2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atxn3Q9CVD2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atxn3Q9CVD2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atxn3Q9CVD2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atxn3Q9CVD2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atxn3Q9CVD2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atxn3Q9CVD2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atxn3Q9CVD2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atxn3Q9CVD2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atxn3Q9CVD2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atxn3Q9CVD2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atxn3Q9CVD2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atxn3Q9CVD2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atxn3Q9CVD2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atxn3Q9CVD2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atxn3Q9CVD2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Atxn3Q9CVD2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atxn3Q9CVD2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atxn3Q9CVD2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms