Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms