Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms