Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRW3

UPF0538 protein C2orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRW3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CRW3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CRW3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CRW3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CRW3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CRW3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CRW3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CRW3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CRW3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CRW3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CRW3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CRW3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CRW3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CRW3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CRW3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CRW3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CRW3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CRW3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CRW3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CRW3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CRW3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CRW3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CRW3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CRW3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CRW3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CRW3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CRW3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CRW3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CRW3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CRW3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CRW3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CRW3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CRW3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CRW3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CRW3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CRW3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CRW3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CRW3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CRW3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CRW3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CRW3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CRW3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CRW3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CRW3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CRW3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CRW3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CRW3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CRW3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CRW3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CRW3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CRW3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CRW3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CRW3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CRW3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CRW3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CRW3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CRW3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CRW3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CRW3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CRW3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CRW3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CRW3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CRW3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CRW3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CRW3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CRW3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CRW3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CRW3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CRW3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CRW3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CRW3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CRW3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CRW3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CRW3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CRW3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CRW3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CRW3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CRW3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CRW3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CRW3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CRW3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CRW3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CRW3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CRW3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CRW3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CRW3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CRW3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CRW3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CRW3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CRW3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CRW3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CRW3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CRW3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CRW3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CRW3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CRW3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CRW3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CRW3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CRW3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CRW3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 972.4 ms