Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA7

Atp5s, ATP synthase subunit s, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5sQ9CRA7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atp5sQ9CRA7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp5sQ9CRA7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp5sQ9CRA7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp5sQ9CRA7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp5sQ9CRA7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp5sQ9CRA7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp5sQ9CRA7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp5sQ9CRA7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp5sQ9CRA7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp5sQ9CRA7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp5sQ9CRA7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp5sQ9CRA7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp5sQ9CRA7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp5sQ9CRA7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp5sQ9CRA7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp5sQ9CRA7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp5sQ9CRA7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp5sQ9CRA7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms