Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA4

Msmo1, Methylsterol monooxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msmo1Q9CRA4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms