Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQU3

Rer1, Protein RER1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rer1Q9CQU3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms