Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc2Q9CQP2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc2Q9CQP2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc2Q9CQP2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc2Q9CQP2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc2Q9CQP2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc2Q9CQP2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc2Q9CQP2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc2Q9CQP2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc2Q9CQP2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc2Q9CQP2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc2Q9CQP2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc2Q9CQP2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc2Q9CQP2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc2Q9CQP2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc2Q9CQP2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc2Q9CQP2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc2Q9CQP2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc2Q9CQP2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc2Q9CQP2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc2Q9CQP2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc2Q9CQP2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc2Q9CQP2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc2Q9CQP2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc2Q9CQP2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc2Q9CQP2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc2Q9CQP2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc2Q9CQP2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc2Q9CQP2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc2Q9CQP2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc2Q9CQP2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc2Q9CQP2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc2Q9CQP2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc2Q9CQP2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc2Q9CQP2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc2Q9CQP2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc2Q9CQP2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc2Q9CQP2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc2Q9CQP2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc2Q9CQP2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc2Q9CQP2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc2Q9CQP2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc2Q9CQP2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc2Q9CQP2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc2Q9CQP2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc2Q9CQP2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc2Q9CQP2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc2Q9CQP2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc2Q9CQP2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc2Q9CQP2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc2Q9CQP2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc2Q9CQP2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc2Q9CQP2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc2Q9CQP2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc2Q9CQP2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc2Q9CQP2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc2Q9CQP2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc2Q9CQP2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc2Q9CQP2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc2Q9CQP2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc2Q9CQP2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc2Q9CQP2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc2Q9CQP2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc2Q9CQP2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc2Q9CQP2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc2Q9CQP2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc2Q9CQP2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc2Q9CQP2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms