Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccer1Q9CQL2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccer1Q9CQL2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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