Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms