Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Atp6v0e1Q9CQD8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Atp6v0e1Q9CQD8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Atp6v0e1Q9CQD8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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Atp6v0e1Q9CQD8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Atp6v0e1Q9CQD8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Atp6v0e1Q9CQD8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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Atp6v0e1Q9CQD8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Atp6v0e1Q9CQD8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Atp6v0e1Q9CQD8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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