Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms