Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ77

1700129C05Rik, 1700129C05Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700129C05RikQ9CQ77 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700129C05RikQ9CQ77 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
1700129C05RikQ9CQ77 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700129C05RikQ9CQ77 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700129C05RikQ9CQ77 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700129C05RikQ9CQ77 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700129C05RikQ9CQ77 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700129C05RikQ9CQ77 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700129C05RikQ9CQ77 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
1700129C05RikQ9CQ77 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
1700129C05RikQ9CQ77 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
1700129C05RikQ9CQ77 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
1700129C05RikQ9CQ77 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
1700129C05RikQ9CQ77 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
1700129C05RikQ9CQ77 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
1700129C05RikQ9CQ77 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
1700129C05RikQ9CQ77 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
1700129C05RikQ9CQ77 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
1700129C05RikQ9CQ77 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
1700129C05RikQ9CQ77 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
1700129C05RikQ9CQ77 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
1700129C05RikQ9CQ77 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
1700129C05RikQ9CQ77 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
1700129C05RikQ9CQ77 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
1700129C05RikQ9CQ77 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
1700129C05RikQ9CQ77 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
1700129C05RikQ9CQ77 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
1700129C05RikQ9CQ77 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
1700129C05RikQ9CQ77 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms