Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ36

Pole4, DNA polymerase epsilon subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole4Q9CQ36 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pole4Q9CQ36 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pole4Q9CQ36 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pole4Q9CQ36 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pole4Q9CQ36 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pole4Q9CQ36 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pole4Q9CQ36 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Pole4Q9CQ36 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Pole4Q9CQ36 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pole4Q9CQ36 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pole4Q9CQ36 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pole4Q9CQ36 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pole4Q9CQ36 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pole4Q9CQ36 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pole4Q9CQ36 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms