Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt88Q9CPR6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt88Q9CPR6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt88Q9CPR6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt88Q9CPR6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt88Q9CPR6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt88Q9CPR6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt88Q9CPR6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt88Q9CPR6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt88Q9CPR6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt88Q9CPR6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt88Q9CPR6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt88Q9CPR6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt88Q9CPR6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt88Q9CPR6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt88Q9CPR6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt88Q9CPR6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt88Q9CPR6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt88Q9CPR6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt88Q9CPR6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt88Q9CPR6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt88Q9CPR6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt88Q9CPR6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt88Q9CPR6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt88Q9CPR6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt88Q9CPR6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt88Q9CPR6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt88Q9CPR6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt88Q9CPR6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt88Q9CPR6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt88Q9CPR6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Krt88Q9CPR6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Krt88Q9CPR6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms