Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.3 ms