Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms