Protein–RNA interactions for Protein: Q99P58

Rab27b, Ras-related protein Rab-27B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab27bQ99P58 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms