Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms