Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB1

Acss1, Acetyl-coenzyme A synthetase 2-like, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acss1Q99NB1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Acss1Q99NB1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Acss1Q99NB1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Acss1Q99NB1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Acss1Q99NB1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Acss1Q99NB1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Acss1Q99NB1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Acss1Q99NB1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Acss1Q99NB1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms