Protein–RNA interactions for Protein: Q99N10

Ms4a8, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 8, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a8Q99N10 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ms4a8Q99N10 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ms4a8Q99N10 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ms4a8Q99N10 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ms4a8Q99N10 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ms4a8Q99N10 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ms4a8Q99N10 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ms4a8Q99N10 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ms4a8Q99N10 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ms4a8Q99N10 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ms4a8Q99N10 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ms4a8Q99N10 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ms4a8Q99N10 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ms4a8Q99N10 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ms4a8Q99N10 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ms4a8Q99N10 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ms4a8Q99N10 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ms4a8Q99N10 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ms4a8Q99N10 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ms4a8Q99N10 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ms4a8Q99N10 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ms4a8Q99N10 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ms4a8Q99N10 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ms4a8Q99N10 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ms4a8Q99N10 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ms4a8Q99N10 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ms4a8Q99N10 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ms4a8Q99N10 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ms4a8Q99N10 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ms4a8Q99N10 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ms4a8Q99N10 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ms4a8Q99N10 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ms4a8Q99N10 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Ms4a8Q99N10 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a8Q99N10 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a8Q99N10 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a8Q99N10 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ms4a8Q99N10 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ms4a8Q99N10 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ms4a8Q99N10 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a8Q99N10 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a8Q99N10 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a8Q99N10 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ms4a8Q99N10 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ms4a8Q99N10 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a8Q99N10 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a8Q99N10 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a8Q99N10 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a8Q99N10 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a8Q99N10 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a8Q99N10 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a8Q99N10 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ms4a8Q99N10 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ms4a8Q99N10 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ms4a8Q99N10 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ms4a8Q99N10 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ms4a8Q99N10 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ms4a8Q99N10 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ms4a8Q99N10 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ms4a8Q99N10 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ms4a8Q99N10 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ms4a8Q99N10 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ms4a8Q99N10 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ms4a8Q99N10 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ms4a8Q99N10 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ms4a8Q99N10 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ms4a8Q99N10 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ms4a8Q99N10 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ms4a8Q99N10 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ms4a8Q99N10 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ms4a8Q99N10 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ms4a8Q99N10 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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