Protein–RNA interactions for Protein: Q99N09

Ms4a6b, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6B, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6bQ99N09 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a6bQ99N09 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a6bQ99N09 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a6bQ99N09 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a6bQ99N09 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a6bQ99N09 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a6bQ99N09 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms