Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN9

Pccb, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PccbQ99MN9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms