Protein–RNA interactions for Protein: Q99MK9

Rassf1, Ras association domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf1Q99MK9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rassf1Q99MK9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rassf1Q99MK9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rassf1Q99MK9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rassf1Q99MK9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rassf1Q99MK9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rassf1Q99MK9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rassf1Q99MK9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rassf1Q99MK9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rassf1Q99MK9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rassf1Q99MK9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rassf1Q99MK9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms