Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gdpd3Q99LY2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms