Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RtcbQ99LF4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RtcbQ99LF4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RtcbQ99LF4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RtcbQ99LF4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RtcbQ99LF4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RtcbQ99LF4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RtcbQ99LF4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RtcbQ99LF4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RtcbQ99LF4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RtcbQ99LF4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RtcbQ99LF4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RtcbQ99LF4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RtcbQ99LF4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RtcbQ99LF4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RtcbQ99LF4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RtcbQ99LF4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RtcbQ99LF4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RtcbQ99LF4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RtcbQ99LF4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RtcbQ99LF4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RtcbQ99LF4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RtcbQ99LF4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RtcbQ99LF4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RtcbQ99LF4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RtcbQ99LF4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RtcbQ99LF4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RtcbQ99LF4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RtcbQ99LF4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RtcbQ99LF4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RtcbQ99LF4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RtcbQ99LF4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RtcbQ99LF4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RtcbQ99LF4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RtcbQ99LF4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RtcbQ99LF4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RtcbQ99LF4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RtcbQ99LF4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RtcbQ99LF4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RtcbQ99LF4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RtcbQ99LF4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RtcbQ99LF4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RtcbQ99LF4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RtcbQ99LF4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RtcbQ99LF4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RtcbQ99LF4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RtcbQ99LF4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RtcbQ99LF4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RtcbQ99LF4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RtcbQ99LF4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RtcbQ99LF4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RtcbQ99LF4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RtcbQ99LF4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RtcbQ99LF4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RtcbQ99LF4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RtcbQ99LF4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RtcbQ99LF4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RtcbQ99LF4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RtcbQ99LF4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RtcbQ99LF4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RtcbQ99LF4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RtcbQ99LF4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RtcbQ99LF4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RtcbQ99LF4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RtcbQ99LF4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RtcbQ99LF4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RtcbQ99LF4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RtcbQ99LF4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RtcbQ99LF4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RtcbQ99LF4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RtcbQ99LF4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RtcbQ99LF4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RtcbQ99LF4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RtcbQ99LF4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RtcbQ99LF4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RtcbQ99LF4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RtcbQ99LF4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RtcbQ99LF4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RtcbQ99LF4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RtcbQ99LF4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RtcbQ99LF4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RtcbQ99LF4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RtcbQ99LF4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RtcbQ99LF4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RtcbQ99LF4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RtcbQ99LF4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RtcbQ99LF4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RtcbQ99LF4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RtcbQ99LF4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RtcbQ99LF4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RtcbQ99LF4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RtcbQ99LF4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RtcbQ99LF4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RtcbQ99LF4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RtcbQ99LF4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RtcbQ99LF4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RtcbQ99LF4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RtcbQ99LF4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RtcbQ99LF4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RtcbQ99LF4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms