Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nmd3Q99L48 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nmd3Q99L48 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nmd3Q99L48 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Nmd3Q99L48 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nmd3Q99L48 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nmd3Q99L48 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nmd3Q99L48 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nmd3Q99L48 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nmd3Q99L48 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nmd3Q99L48 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nmd3Q99L48 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nmd3Q99L48 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nmd3Q99L48 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nmd3Q99L48 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Nmd3Q99L48 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nmd3Q99L48 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nmd3Q99L48 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nmd3Q99L48 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms