Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms