Protein–RNA interactions for Protein: Q99K51

Pls3, Plastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pls3Q99K51 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pls3Q99K51 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pls3Q99K51 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pls3Q99K51 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pls3Q99K51 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pls3Q99K51 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pls3Q99K51 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pls3Q99K51 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pls3Q99K51 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pls3Q99K51 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pls3Q99K51 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pls3Q99K51 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pls3Q99K51 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pls3Q99K51 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pls3Q99K51 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pls3Q99K51 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pls3Q99K51 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pls3Q99K51 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Pls3Q99K51 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pls3Q99K51 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Pls3Q99K51 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pls3Q99K51 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pls3Q99K51 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pls3Q99K51 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pls3Q99K51 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pls3Q99K51 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Pls3Q99K51 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pls3Q99K51 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pls3Q99K51 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pls3Q99K51 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pls3Q99K51 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pls3Q99K51 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pls3Q99K51 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms