Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms