Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apobec3Q99J72 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apobec3Q99J72 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apobec3Q99J72 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apobec3Q99J72 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apobec3Q99J72 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apobec3Q99J72 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Apobec3Q99J72 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apobec3Q99J72 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Apobec3Q99J72 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apobec3Q99J72 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apobec3Q99J72 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apobec3Q99J72 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Apobec3Q99J72 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apobec3Q99J72 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apobec3Q99J72 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apobec3Q99J72 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apobec3Q99J72 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apobec3Q99J72 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apobec3Q99J72 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apobec3Q99J72 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apobec3Q99J72 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apobec3Q99J72 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apobec3Q99J72 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apobec3Q99J72 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apobec3Q99J72 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apobec3Q99J72 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apobec3Q99J72 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apobec3Q99J72 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apobec3Q99J72 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apobec3Q99J72 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Apobec3Q99J72 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Apobec3Q99J72 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Apobec3Q99J72 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Apobec3Q99J72 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Apobec3Q99J72 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Apobec3Q99J72 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Apobec3Q99J72 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Apobec3Q99J72 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Apobec3Q99J72 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apobec3Q99J72 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apobec3Q99J72 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apobec3Q99J72 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apobec3Q99J72 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apobec3Q99J72 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apobec3Q99J72 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apobec3Q99J72 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apobec3Q99J72 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apobec3Q99J72 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Apobec3Q99J72 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Apobec3Q99J72 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Apobec3Q99J72 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Apobec3Q99J72 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Apobec3Q99J72 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Apobec3Q99J72 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Apobec3Q99J72 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Apobec3Q99J72 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apobec3Q99J72 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apobec3Q99J72 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apobec3Q99J72 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apobec3Q99J72 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apobec3Q99J72 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Apobec3Q99J72 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apobec3Q99J72 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apobec3Q99J72 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apobec3Q99J72 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apobec3Q99J72 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Apobec3Q99J72 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms