Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

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Length 585 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms