Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Spdl1Q923A2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Spdl1Q923A2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Spdl1Q923A2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Spdl1Q923A2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Spdl1Q923A2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Spdl1Q923A2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Spdl1Q923A2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Spdl1Q923A2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Spdl1Q923A2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Spdl1Q923A2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Spdl1Q923A2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms