Protein–RNA interactions for Protein: Q921W0

Chmp1a, Charged multivesicular body protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1aQ921W0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp1aQ921W0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp1aQ921W0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp1aQ921W0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp1aQ921W0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp1aQ921W0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp1aQ921W0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp1aQ921W0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp1aQ921W0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp1aQ921W0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp1aQ921W0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp1aQ921W0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp1aQ921W0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp1aQ921W0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp1aQ921W0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp1aQ921W0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp1aQ921W0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp1aQ921W0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp1aQ921W0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp1aQ921W0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp1aQ921W0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp1aQ921W0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp1aQ921W0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp1aQ921W0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp1aQ921W0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp1aQ921W0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp1aQ921W0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp1aQ921W0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp1aQ921W0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp1aQ921W0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp1aQ921W0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp1aQ921W0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp1aQ921W0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp1aQ921W0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp1aQ921W0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp1aQ921W0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Chmp1aQ921W0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Chmp1aQ921W0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Chmp1aQ921W0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp1aQ921W0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp1aQ921W0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp1aQ921W0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp1aQ921W0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp1aQ921W0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp1aQ921W0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp1aQ921W0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp1aQ921W0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp1aQ921W0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp1aQ921W0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp1aQ921W0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp1aQ921W0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp1aQ921W0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp1aQ921W0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp1aQ921W0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp1aQ921W0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp1aQ921W0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp1aQ921W0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp1aQ921W0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp1aQ921W0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp1aQ921W0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp1aQ921W0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp1aQ921W0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp1aQ921W0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp1aQ921W0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp1aQ921W0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp1aQ921W0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp1aQ921W0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp1aQ921W0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp1aQ921W0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp1aQ921W0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp1aQ921W0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp1aQ921W0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp1aQ921W0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp1aQ921W0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp1aQ921W0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp1aQ921W0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp1aQ921W0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp1aQ921W0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp1aQ921W0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp1aQ921W0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp1aQ921W0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp1aQ921W0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp1aQ921W0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp1aQ921W0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp1aQ921W0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp1aQ921W0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp1aQ921W0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp1aQ921W0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp1aQ921W0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp1aQ921W0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp1aQ921W0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp1aQ921W0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp1aQ921W0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp1aQ921W0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp1aQ921W0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp1aQ921W0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp1aQ921W0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp1aQ921W0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp1aQ921W0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp1aQ921W0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms