Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Med28Q920D3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms