Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smarca5Q91ZW3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms