Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZD5

Cts3, Cathepsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cts3Q91ZD5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cts3Q91ZD5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cts3Q91ZD5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cts3Q91ZD5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cts3Q91ZD5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cts3Q91ZD5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cts3Q91ZD5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cts3Q91ZD5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cts3Q91ZD5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cts3Q91ZD5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cts3Q91ZD5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cts3Q91ZD5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cts3Q91ZD5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cts3Q91ZD5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cts3Q91ZD5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cts3Q91ZD5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cts3Q91ZD5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cts3Q91ZD5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cts3Q91ZD5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cts3Q91ZD5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cts3Q91ZD5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cts3Q91ZD5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cts3Q91ZD5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cts3Q91ZD5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cts3Q91ZD5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cts3Q91ZD5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cts3Q91ZD5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cts3Q91ZD5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cts3Q91ZD5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cts3Q91ZD5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cts3Q91ZD5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cts3Q91ZD5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cts3Q91ZD5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms