Protein–RNA interactions for Protein: Q91WL6

Snx11, Sorting nexin-11, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx11Q91WL6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx11Q91WL6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx11Q91WL6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx11Q91WL6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx11Q91WL6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx11Q91WL6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx11Q91WL6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx11Q91WL6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx11Q91WL6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx11Q91WL6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx11Q91WL6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx11Q91WL6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx11Q91WL6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx11Q91WL6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx11Q91WL6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx11Q91WL6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx11Q91WL6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx11Q91WL6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx11Q91WL6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx11Q91WL6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx11Q91WL6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx11Q91WL6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx11Q91WL6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx11Q91WL6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx11Q91WL6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx11Q91WL6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx11Q91WL6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx11Q91WL6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx11Q91WL6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx11Q91WL6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx11Q91WL6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx11Q91WL6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx11Q91WL6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx11Q91WL6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx11Q91WL6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx11Q91WL6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx11Q91WL6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx11Q91WL6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx11Q91WL6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx11Q91WL6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx11Q91WL6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx11Q91WL6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx11Q91WL6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx11Q91WL6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx11Q91WL6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx11Q91WL6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx11Q91WL6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx11Q91WL6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx11Q91WL6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx11Q91WL6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx11Q91WL6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx11Q91WL6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx11Q91WL6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx11Q91WL6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx11Q91WL6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx11Q91WL6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx11Q91WL6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx11Q91WL6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx11Q91WL6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx11Q91WL6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx11Q91WL6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx11Q91WL6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx11Q91WL6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx11Q91WL6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx11Q91WL6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx11Q91WL6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx11Q91WL6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx11Q91WL6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx11Q91WL6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx11Q91WL6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx11Q91WL6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx11Q91WL6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx11Q91WL6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx11Q91WL6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx11Q91WL6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx11Q91WL6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx11Q91WL6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx11Q91WL6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx11Q91WL6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx11Q91WL6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx11Q91WL6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx11Q91WL6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx11Q91WL6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx11Q91WL6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx11Q91WL6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx11Q91WL6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx11Q91WL6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx11Q91WL6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx11Q91WL6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx11Q91WL6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx11Q91WL6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx11Q91WL6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx11Q91WL6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx11Q91WL6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx11Q91WL6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx11Q91WL6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx11Q91WL6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx11Q91WL6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx11Q91WL6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx11Q91WL6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms