Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms