Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEM9

Klhdc3, Kelch domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc3Q8VEM9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhdc3Q8VEM9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms