Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vps4aQ8VEJ9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vps4aQ8VEJ9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vps4aQ8VEJ9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vps4aQ8VEJ9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vps4aQ8VEJ9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vps4aQ8VEJ9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps4aQ8VEJ9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps4aQ8VEJ9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps4aQ8VEJ9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps4aQ8VEJ9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps4aQ8VEJ9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps4aQ8VEJ9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps4aQ8VEJ9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps4aQ8VEJ9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps4aQ8VEJ9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps4aQ8VEJ9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps4aQ8VEJ9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps4aQ8VEJ9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps4aQ8VEJ9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps4aQ8VEJ9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vps4aQ8VEJ9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps4aQ8VEJ9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps4aQ8VEJ9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps4aQ8VEJ9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps4aQ8VEJ9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps4aQ8VEJ9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Vps4aQ8VEJ9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vps4aQ8VEJ9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Vps4aQ8VEJ9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Vps4aQ8VEJ9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Vps4aQ8VEJ9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps4aQ8VEJ9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Vps4aQ8VEJ9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vps4aQ8VEJ9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps4aQ8VEJ9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Vps4aQ8VEJ9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps4aQ8VEJ9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps4aQ8VEJ9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps4aQ8VEJ9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps4aQ8VEJ9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps4aQ8VEJ9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps4aQ8VEJ9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps4aQ8VEJ9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps4aQ8VEJ9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps4aQ8VEJ9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps4aQ8VEJ9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps4aQ8VEJ9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps4aQ8VEJ9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps4aQ8VEJ9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps4aQ8VEJ9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps4aQ8VEJ9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps4aQ8VEJ9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps4aQ8VEJ9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps4aQ8VEJ9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps4aQ8VEJ9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps4aQ8VEJ9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps4aQ8VEJ9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps4aQ8VEJ9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps4aQ8VEJ9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps4aQ8VEJ9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps4aQ8VEJ9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps4aQ8VEJ9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps4aQ8VEJ9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps4aQ8VEJ9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps4aQ8VEJ9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps4aQ8VEJ9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps4aQ8VEJ9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms