Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Fyco1Q8VDC1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Fyco1Q8VDC1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Fyco1Q8VDC1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Fyco1Q8VDC1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Fyco1Q8VDC1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Fyco1Q8VDC1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Fyco1Q8VDC1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Fyco1Q8VDC1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Fyco1Q8VDC1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Fyco1Q8VDC1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Fyco1Q8VDC1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Fyco1Q8VDC1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Fyco1Q8VDC1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Fyco1Q8VDC1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Fyco1Q8VDC1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Fyco1Q8VDC1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Fyco1Q8VDC1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Fyco1Q8VDC1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Fyco1Q8VDC1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Fyco1Q8VDC1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Fyco1Q8VDC1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Fyco1Q8VDC1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Fyco1Q8VDC1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Fyco1Q8VDC1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Fyco1Q8VDC1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Fyco1Q8VDC1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Fyco1Q8VDC1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Fyco1Q8VDC1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Fyco1Q8VDC1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Fyco1Q8VDC1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Fyco1Q8VDC1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Fyco1Q8VDC1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Fyco1Q8VDC1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Fyco1Q8VDC1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Fyco1Q8VDC1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Fyco1Q8VDC1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Fyco1Q8VDC1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Fyco1Q8VDC1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Fyco1Q8VDC1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Fyco1Q8VDC1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Fyco1Q8VDC1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Fyco1Q8VDC1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Fyco1Q8VDC1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Fyco1Q8VDC1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Fyco1Q8VDC1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Fyco1Q8VDC1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Fyco1Q8VDC1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Fyco1Q8VDC1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Fyco1Q8VDC1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Fyco1Q8VDC1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Fyco1Q8VDC1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Fyco1Q8VDC1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Fyco1Q8VDC1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Fyco1Q8VDC1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Fyco1Q8VDC1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Fyco1Q8VDC1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Fyco1Q8VDC1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Fyco1Q8VDC1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Fyco1Q8VDC1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Fyco1Q8VDC1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Fyco1Q8VDC1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Fyco1Q8VDC1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Fyco1Q8VDC1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Fyco1Q8VDC1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Fyco1Q8VDC1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Fyco1Q8VDC1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Fyco1Q8VDC1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Fyco1Q8VDC1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Fyco1Q8VDC1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Fyco1Q8VDC1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Fyco1Q8VDC1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Fyco1Q8VDC1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Fyco1Q8VDC1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Fyco1Q8VDC1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Fyco1Q8VDC1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Fyco1Q8VDC1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Fyco1Q8VDC1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Fyco1Q8VDC1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Fyco1Q8VDC1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Fyco1Q8VDC1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Fyco1Q8VDC1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Fyco1Q8VDC1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Fyco1Q8VDC1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Fyco1Q8VDC1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Fyco1Q8VDC1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Fyco1Q8VDC1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Fyco1Q8VDC1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fyco1Q8VDC1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fyco1Q8VDC1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fyco1Q8VDC1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fyco1Q8VDC1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fyco1Q8VDC1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Fyco1Q8VDC1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fyco1Q8VDC1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fyco1Q8VDC1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fyco1Q8VDC1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fyco1Q8VDC1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fyco1Q8VDC1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fyco1Q8VDC1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms